琉球畳の上に机と椅子を置くことも考えているのですが、キャスター付の椅子は使用できないでしょうか。(=琉球畳が凹んでしまうでしょうか)

キャスターですと重みが分散されるので大丈夫かと思いますが、畳表が摩擦で傷んでしまうと思います。